海洋藻类保种中心（Center for Collections of Marine Algae，CCMA）隶属于近海海洋环境科学国家重点实验室（厦门大学）中心平台。创建于2005年，初期主要以海洋藻类保种为主。2007年11月顺利搬迁并快速步入正轨。针对中国沿海及其临近海域具有特殊生态功能的浮游植物（藻类），广泛而系统地开展分离筛选、鉴定和保存工作。为重点实验室及相关单位研究人员提供科学研究及教育等方面的材料，特别是973、863、国家重大及重点项目等课题。目前我们的任务是进一步完善藻种室的建设和管理以提高效率，加大与国内、国际间的交流与合作，为国内外研究人员提供科学研究、微生物资源的应用开发等提供可靠的藻种来源。

中心目前拥有一间10万级无菌保种室和一间藻类培养室，分别用于藻种的保存和培养。主要仪器设备有：海水过滤系统、单细胞操作系统、各类显微观察设备、图像采集系统、光照培养箱和大容积脉动真空蒸汽灭菌器等。

藻种库现保存有蓝、绿、硅、甲、裸、隐、金、黄等藻类，主要以甲、硅、绿为主，共计400余株系。每年中心均搭乘航次，从台湾海峡、南海、东海及厦门港分离新的株系，并运用分子生物学及扫描电镜等技术进行鉴定。

目前，CCMA已发展成为我国海洋藻种保藏、提供和交换的重要机构，平均每年为校内外科研及教学单位提供1000株/次藻种。

常用藻株：